Pedro Antonio Moreno Tovar Assistant Professor at Universidad del Valle School of Systems and Computing Engineering



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Pedro Antonio Moreno Tovar

Assistant Professor at Universidad del Valle

School of Systems and Computing Engineering

(Escuela de Ingeniería de Sistemas y Computación, EISC)


Address: Calle 13 # 100-00. Cali – Colombia

E-mail: pedro.moreno@correounivalle.edu.co

URL: http://eisc.univalle.edu.co; http://bioinformatica.univalle.edu.co

Phone office: +57-2-3391745. Ext. 2782. Fax: +57-2-3329671



Linkedin: Pedro A. Moreno
Education:

Ph. D. in biology, 2004. University of Houston, Houston, TX. USA.

Diploma in biology, 1988. Universidad Nacional de Colombia. Bogotá, D. C.
Positions:

Acting Director (2011- current). Bioinformatics laboratory at EISC.

EISC-Postgraduate Coordinator 2010-2011. Universidad del Valle. Cali, Colombia.

Assistant Professor. 2005 – current. Universidad del Valle. Cali, Colombia.

Teaching Assistant. 2003-2004. University of Houston. Houston, TX. USA.

Research Assistant. University of Houston. 1998-2002. Houston, TX. USA.

Professor. Pontificia Universidad Javeriana. 1993-1998. Bogotá, D. C. Colombia.

Specialist researcher. Instituto de Inmunología. 1991 – 1993. Bogotá, D. C. Colombia.

Researcher and Occasional professor. Universidad Nacional de Colombia. 1988 – 1990. Bogotá, Colombia.
Grants and projects:

- Center for biomedicine, bioengineering, biocomputing of Colombian southwestern. In preparation to be submitted to the Colombian royalties program.

-Compared multifractal analysis of human genomes (specie-specific). 2012. To be submitted to Colciencias.

-GeBiX Colombian Center for Genomics and Bioinformatics of Extreme Environments. Colciencias. 2008-2011. In progress.

-Multifractal analysis of eukaryotes genomes. Colciencias. 2005-2007. Finished.

Peer review papers:

1. Moreno PA, Vélez PE, Téllez C, Martínez E, Tobar F. (2012) An integrative software for multifractal analyses in human genomes. (In prep. to be submitted to BMC Bioinformatics)


2. Moreno PA, Vélez PE, Arteaga C. (2012). Multifractal analysis of the human genetic diseases. In prep.
3. Tobar F, Rodríguez AC, Vélez PE, Zambrano MM, Moreno PA. (2012). Exploration of noncoding sequences in metagenomes. In prep.
4. Andrade CA, Méndez CA, Salazar L, Bolaños G, Vélez PE, Moreno PA, Cabrera J. (2012). Caracterización eléctrica de DNA humano con síndrome de inmuno deficiencia adquirida. In prep.

5. Moreno PA, Vélez PE, Martínez E, Garreta L, Díaz D, Amador S, Gutiérrez JM, Tischer I, Naik AK, Tobar F, García F. (2011). The human genome: a multifractal analysis. BMC Genomics 12:506 doi:10.1186/1471-2164-12-506.


6. Almanza MI, López-López K, Moreno PA, Téllez CE (2010). Evidencias empíricas de regularidades estadísticas y leyes de potencia en los genomas de Arabidopsis thaliana, Oriza sativa y Mus musculus. Acta Agronómica 59(3):257-272.
7. Vélez PE, Garreta LE, Martínez E, Díaz N, Amador S, Gutiérrez JM, Tischer I, Moreno PA. (2010). The Caenorhabditis elegans genome: a multifractal analysis. Genet and Mol Res 9:949-965.

8. Restrepo S, Pinzón A, Rodríguez-R LM, Sierra R, Grajales A, Bernal A, Barreto E, Moreno PA, Zambrano MM, Cristancho M, González A, Castro H. (2009) Computational biology in Colombia. PLoS Comput Biol. 5(10):e1000535.

9. Tobar F, Moreno PA, Vélez PE (2009) Highly conserved regions in the 5’ region of the human olfactory receptor genes. Genet and Mol Res, 8:117-128.

10. Martin, K, Janet L. Siefert J, Lu Y, Moreno PA, Widger WR, Fox GE. (2003). Cyanobacterial Signature Genes. Photosynthesis Research. 75:211 – 221.

11. Moreno PA, Rodríguez JG, Vélez PE, Cubillos JR, Del Portillo P. (2002). La genómica aplicada en salud humana. Colombia Ciencia y Tecnología. Colciencias. Jul-Sep. 20:14-21.

12. Hilton MJ, Gutiérrez L, Zhang L, Moreno PA, Reddy M, Brown N, Tan Y, Hill A, Wells DE. (2001). An integrated physical map of 8q22-q24: use in positional cloning and deletion analysis of Langer-Giedion syndrome. Genomics. 71(2):192-9.

13. Soto CY, Moreno PA, Valencia JT, Bernal MM, Guzmán F, Patarroyo MP, Murillo LA. (1999). Isolation, characterization, molecular cloning and amplification of a species-specific M. leprae antigen. Int. J. Lepr. Other Mycobact. Dis. 67(4):392-402.

14. Burgos JD, Moreno-Tovar P. (1996). Zipf scaling behavior in the immune system. BioSystem. 39:227-232.

15. Burgos JD, Estévez CM, Moreno P, Rodríguez J, Verdugo A. (1996). Geometría fractal en biología molecular e inmunología. Rev. Cient. UNINCCA. 2 (2): 17-25.

16. Burgos JD, Moreno PA. (1995). Un modelo fractal del repertorio inmune de células Bs. Rev. Asoc. Col. Ciencias Biol. 9 (1-2):73-77.


Books

1. Moreno PA, Vélez PE, Burgos JD. (2009). Biología Molecular, Genómica y Post-Genómica. Pioneros, principios y tecnologías. Editorial Universidad del Cauca. Popayán. (ISBN: 978-958-945136-6).

2. The 2nd International seminar on genomics, proteomics, bioinformatics, and systems biology. (2006). Editores: Patricia E. Vélez y Pedro A. Moreno. October, 25-27. Editorial Universidad del Cauca. Popayán. (ISBN: 978-958-9451-21-2).

3. Moreno PA. (2004). Large scale and small scale bioinformatics studies on the Caenorhabditis elegans genome. Doctoral thesis. University of Houston. Houston, TX, USA. 1-216.

4. Vélez PE, Moreno PA. (2003). Atlas de Biología Molecular. Presentación animada en Flash, CD-ROM y en la red. (ISBN: 958-33-5618-2).

5. Rodríguez E, Moreno PA, (1988). Construcción de una genoteca de ADN-Recombinante para el aislamiento de clonos de genes del Mycobacterium tuberculosis. Tesis de pregrado en biología – Mención: meritoria. Universidad Nacional de Colombia. Bogotá, DC.


Electronic publications and registers

1. Espitia HF, Tischer I , Moreno PA. Software de bioinformática para el análisis multifractal en secuencias de ADN y proteínas mediante el método de “sand-box”. Ministerio del Interior y de Justicia. Dirección Nacional de Derecho de Autor. Certificado de registro de soporte lógico – software. 13-28-383. 01-Abr-2011.


2. Ciprian M, Tischer I , Moreno PA. Software para el ensamblaje y alineamiento de secuencias metagenómicas de manera distribuida usando computación pública o voluntaria. Ministerio del Interior y de Justicia. Dirección Nacional de Derecho de Autor. Certificado de registro de soporte lógico – software. 13-28-352. 31-Mar-2011.
3. Blanco S, Moreno PA. Representación del juego del caos para el análisis de secuencias de ADN y proteínas mediante el análisis multifractal (método “box-counting”). Ministerio del Interior y de Justicia. Dirección Nacional de Derecho de Autor. Certificado de registro de soporte lógico – software. 13-17-441. 02-Mar-2007.
4. Vélez PE, Moreno PA (2004). La investigación genética humana: La banca del ADN y el consentimiento: una cuestión de forma? Traducción autorizada por: el autor. [Deschênes, Ma. Cardinal Ga, Knoppers BMa, Glass K.C. (2001). Opinion. Human genetic research, DNA banking and consent: a question or “form?” Clinical Genetics. 59:221-239]. 1:1–40.

http://www.javeriana.edu.co/Genetica/PDF/GeneticaHumana%20Colciencias.pdf

5. Moreno PA, Soto CY, Valencia JT, Murillo LA, Patarroyo ME. (1999). LOCUS: MLU49838. DEFINITION: Mycobacterium leprae 72.2 KDa protein gene, partial cds. ACCESSION: U49838. http://www.ncbi.nlm.nih.gov

6. Moreno PA, Soto CY, Valencia JT, Murillo LA, Patarroyo ME. (1997). LOCUS: AAD10833. DEFINITION: Mycobacterium leprae 72.2 KDa protein gene, partial cds. ACCESSION: U49838. http://www.ncbi.nlm.nih.gov

Book chapters and conferences

Duarte JE, Velasco-Medina J, Moreno PA. (2011). Hardware simulation of yeast glycolytic oscillations, bibmw, pp.396-399, IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine Workshops.


Henry Tobar, Patricia Vélez Varela, Irene Tischer, Pedro Moreno Tovar. (2011). A bioinformatics pathline for metagenomics analysis, based on structural and functional profiles. Primer congreso Colombiano de biología computacional. Bogotá, DC. No. 136. 38.
Ivon Bolaños Martínez, Maritsa Cruz Muñoz, Patricia Vélez Varela, Carlos Castañeda Olano, Pedro Moreno Tovar. (2011). Fronteras en Genómica: Estado Actual y Perspectivas para la Comunidad Científica Colombiana. Primer congreso Colombiano de biología computacional. Bogotá, DC. No. 139. 120.
Moreno PA. (2009). Perspectives and opportunities in metagenomics. Theoretical and Practical Course on ''Metagenomics and Bioinformatics''. ICGEB Course. Bogota - Colombia june 20-26.

Aranda JA., Moreno PA, Ortiz JJ. (2006). Some models of concurrent programming by restrictions and their applications. A review”. The 2nd International Seminar on Genomics, Proteomics, Bioinformatics, and Systems Biology 2006. Memorias. Popayán. Octubre de 2006. 1-14.


Blanco S, Vélez PE., Moreno PA. (2006). Representation of DNA and protein sequences using the chaos game representation and multifractal analysis”. The 2nd International Seminar on Genomics, Proteomics, Bioinformatics, and Systems Biology 2006. Memorias. Popayán. Octubre de 2006. 17-25.
Moreno PA, Rodríguez A, Vélez PE. (2006). The Cyanobacteria gene core and photosynthesis origin. The 2nd International Seminar on Genomics, Proteomics, Bioinformatics and Systems Biology 2006. Memorias. Popayán. Octubre de 2006. 144-155.
Moreno PA, Vélez PE, Tischer I. (2006). Bioinformatics for biologists, chemists, engineers, and health sciences professionals. The 2nd International Seminar on Genomics, Proteomics, Bioinformatics, and Systems Biology 2006. Memorias. Popayán. Octubre de 2006. 156-167.
Moreno PA, Vélez PE, Tischer I. (2006). A proposal to create a undergraduate bioinformatics program. The 2nd International Seminar on Genomics, Proteomics, Bioinformatics and Systems Biology 2006. Memorias. Popayán. Octubre de 2006. 168-174
Tobar F, Vélez PE, Moreno PA. (2006). The human olphactory gene family. The 2nd International Seminar on Genomics, Proteomics, Bioinformatics, and Systems Biology 2006. Memorias. Popayán. Octubre de 2006. 202 – 204.
Vélez PE, Garreta LE, Martínez E, Flechas A, Siler A, Néstor D, Ashwinikumar NK, Gutíerrez JM, Tischer I, Moreno PA. (2006). Fractal Structure of the Interrupted Genes. The 2nd International Seminar on Genomics, Proteomics, Bioinformatics, and Systems Biology 2006. Memorias. Popayán. Octubre de 2006. 207-208.
Siefert Janet, Lu Yue, Moreno Pedro A, Widger William, Fox George E. (2002). The function of most cyanobacterial signature genes at ~2.1Ga is unknown. Second Astrobiology Science Conference. Houston: NASA, AMES Research Center. En: http://web99.arc.nasa.gov/abscon2/index.cfm o http://www.astrobiology.com/asc2002/abstract html?ascid=361
Pedro A. Moreno, Javier D. Burgos, Patricia E. Vélez, José M. Gutiérrez, Ashwinikumar K. Naik, Alonso Verdugo and George E. Fox. (2000). Multifractal analysis of complete genomes. 12th International Genome Sequencing and Analysis Conference. September 12-15. Miami Beach, FL.
Martin K, Moreno PA, Widger W, Fox GE. (2000). Major differences in gene order between the two cyanobacteria Synechococcus PCC7002 and Synechocystis PCC6803 as revealed by sample sequencing. Genomes 2000: International conference on microbial and model genomes. April 11-15. Paris, France.

Fox GE, Moreno PA, Zhang Z, Hurry J. (2000). Novel Technology for Microbial Monitoring. 2000 Annual Report Environmental Institute of Houston.


Martin Kirt, Moreno PA, Abdi F, Widger W, Fox GE. (1999). Initial comparison of Synechococcus and Synechocystis reveal rapid changes in gene order. Third annual gene functional analysis. March 4-5. San Francisco, CA.
Martin K, Abdi F, Moreno PA, William W, Fox GE. (1998). Contrasting genomes: An initial comparison of Synechococcus and Synechocystis. Microbial & Comparative Genomics. Tenth international genome sequencing and analysis conference. 3(3):C-24. September 17-20. Miami, FL. ISSN:1090-6592.
Gutiérrez JM, Iglesias A, Rodríguez MA, Burgos JD, Moreno PA. (1998). Analyzing the multifractal structure of DNA nucleotide sequences. Chaos and Noise in Biology and Medicine. World Scientific Publishing.  England, 315 - 319.

Moreno PA, Burgos JD, Vélez PE, Estévez CM. (1997). Scaling behavior in the molecular structure of interrupted genes. 4th South-North human genome conference. UNESCO and PLAGH proceedings. 35. March 16 - 19. Guadalajara, México. Abstract.

Pachón Ernesto, Angarita Lulú, Corredor Carlos, De Dulce Bertha, Fajardo Eduardo, Saboyá Miriam, Moreno Pedro, Diez Hugo, Morales Ludis. (1995). Un modelo para la enseñanza de la biología celular molecular. XXX Congreso Nacional de Ciencias Biológicas. Organizado por la ACCB. Bogotá, D. C. Pág. 83-84. ISSN:0120-4173.

Moreno, T. Pedro, Burgos, D. Javier y Estévez, Carlos. (1995). La estructura fractal de los genes. XXX Congreso Nacional de Ciencias Biológicas. Organizado por la ACCB. Bogotá, D. C. Pág.61. ISSN:0120-4173.

Burgos, D. Javier y Moreno, T. Pedro. (1995). La estructura fractal del repertorio inmune de las células B. XXX Congreso Nacional de Ciencias Biológicas. Organizado por la ACCB. Bogotá, D. C. Pág. 47. ISSN:0120-4173.



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